Řídicí systém je základní součástí vertikálního obráběcího centra. Přijímá povely operátora a řídí pohyb různých součástí stroje. Řídicí systémy obvykle využívají vysoce-přesné CNC systémy, které umožňují složité dráhy obrábění a přesné polohování. Prostřednictvím přesného řízení řídicího systému mohou vertikální obráběcí centra dosahovat vysoce-přesného obrábění, což výrazně zlepšuje efektivitu a kvalitu výroby.
